Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms