Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP36Q96G28 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP36Q96G28 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms