Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms