Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MKL1Q969V6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms