Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BAP1Q92560 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BAP1Q92560 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms