Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD4Q8WVF5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms