Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2f4Q8R0K9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms