Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMB4Q86W47 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms