Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFVQ71UI9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms