Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms