Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HES3Q5TGS1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HES3Q5TGS1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HES3Q5TGS1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms