Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOGA3Q5TF21 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms