Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms