Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms