Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALFQ53S48 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms