Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2CQ496J9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms