Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1lQ3USQ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms