Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC57Q2TAC2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms