Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF239Q16600 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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