Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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