Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUM3Q15397 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
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