Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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