Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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