Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 NBR2-203ENST00000467245 1158 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 23
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ILF3Q12906 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 23
ILF3Q12906 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 KIAA1217-205ENST00000376456 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.85□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 KIAA1217-216ENST00000635504 568 ntTSL 45.11□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 ARID2-204ENST00000427628 323 ntTSL 59.56□□□□□ -0.886e-8■■■■□ 22.9
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ILF3Q12906 ZNF605-203ENST00000381215 1143 ntTSL 1 (best)9.86□□□□□ -0.833e-8■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.063e-8■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 ZNF605-205ENST00000412621 541 ntTSL 46.67□□□□□ -1.343e-8■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.433e-8■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.64e-9■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.514e-9■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.184e-9■■■■□ 22.9
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ILF3Q12906 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.075e-7■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 FAM222B-206ENST00000579381 462 ntTSL 521.67■■□□□ 1.065e-7■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.065e-7■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 FAM222B-207ENST00000581229 598 ntTSL 420.44■□□□□ 0.865e-7■■■■□ 22.9
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ILF3Q12906 FAM222B-214ENST00000583953 564 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.975e-7■■■■□ 22.9
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ILF3Q12906 ZNF714-206ENST00000613286 2696 ntTSL 1 (best)10.47□□□□□ -0.734e-7■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 ZNF714-205ENST00000610902 2671 ntTSL 29.58□□□□□ -0.884e-7■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 ZNF714-201ENST00000425625 2562 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.044e-7■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 ZNF714-210ENST00000620627 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.084e-7■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.184e-7■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.334e-7■■■■□ 22.9
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ILF3Q12906 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.762e-6■■■■□ 22.9
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ILF3Q12906 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.832e-6■■■■□ 22.9
ILF3Q12906 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.92e-6■■■■□ 22.9
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ILF3Q12906 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.64e-10■■■■□ 22.9
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ILF3Q12906 PTRH2-202ENST00000409433 2246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 22.8
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ILF3Q12906 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.119e-8■■■■□ 22.8
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ILF3Q12906 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.029e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PRKRIP1-207ENST00000482549 1625 ntTSL 1 (best)24.29■■□□□ 1.481e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PRKRIP1-204ENST00000469763 1642 ntTSL 523.67■■□□□ 1.381e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PRKRIP1-206ENST00000482465 2257 ntTSL 214.68□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 22.8
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ILF3Q12906 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.383e-8■■■■□ 22.8
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ILF3Q12906 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.533e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.693e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.823e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.573e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.813e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ARID2-203ENST00000426776 484 ntTSL 36.94□□□□□ -1.34e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ELOVL5-204ENST00000465983 696 ntTSL 312.67□□□□□ -0.388e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ELOVL5-206ENST00000486973 794 ntTSL 312.57□□□□□ -0.48e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.528e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ELOVL5-205ENST00000485336 761 ntTSL 59.46□□□□□ -0.98e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.228e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.248e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.438e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.679e-10■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.679e-10■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.329e-10■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.976e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)19.71■□□□□ 0.756e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.446e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NOL4L-208ENST00000475781 1127 ntTSL 516.61■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.226e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.176e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.154e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.154e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.156e-7■■■■□ 22.8
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