Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 ELMO3-204ENST00000571587 780 ntTSL 514.57□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 39.1
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SF3A3Q12874 DTNB-216ENST00000479898 865 ntTSL 314.38□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 39.1
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SF3A3Q12874 RALGAPB-205ENST00000461147 5050 ntTSL 1 (best)3.91□□□□□ -1.781e-6■■■■■ 39.1
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SF3A3Q12874 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 39
SF3A3Q12874 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.73e-10■■■■■ 39
SF3A3Q12874 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 39
SF3A3Q12874 PYGL-205ENST00000532462 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.313e-10■■■■■ 39
SF3A3Q12874 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.56e-10■■■■■ 39
SF3A3Q12874 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.26e-10■■■■■ 39
SF3A3Q12874 ANKRD17-205ENST00000513908 852 ntTSL 28.51□□□□□ -1.056e-10■■■■■ 39
SF3A3Q12874 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.226e-10■■■■■ 39
SF3A3Q12874 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.38□□□□□ -1.396e-10■■■■■ 39
SF3A3Q12874 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.173e-6■■■■■ 38.9
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SF3A3Q12874 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 38.9
SF3A3Q12874 NRBP2-209ENST00000533093 3877 ntTSL 1 (best)19.41■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 38.9
SF3A3Q12874 NRBP2-204ENST00000529747 3693 ntTSL 218.58■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 38.9
SF3A3Q12874 AP5Z1-202ENST00000469614 2337 ntTSL 218.39■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 38.9
SF3A3Q12874 SHC2-205ENST00000590170 816 ntTSL 516.54■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 38.9
SF3A3Q12874 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.022e-6■■■■■ 38.9
Retrieved 100 of 27,864 protein–RNA pairs in 282.6 ms