Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms