Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 TPM2YIL138C 486 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SOP4YJL192C 705 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 UBX4YMR067C 1251 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ATG8YBL078C 354 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 TRS33YOR115C 807 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 IMA2YOL157C 1770 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 HAP4YKL109W 1665 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YCR064CYCR064C 411 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 PHB1YGR132C 864 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ACF4YJR083C 930 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 HAP3YBL021C 435 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YNL285WYNL285W 372 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ATP11YNL315C 957 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YPL185WYPL185W 396 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 GPX2YBR244W 489 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YEL020CYEL020C 1683 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YKL075CYKL075C 1353 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 UTP4YDR324C 2331 nt5.91□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 DSF1YEL070W 1509 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ATE1YGL017W 1512 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YNR073CYNR073C 1509 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YCR101CYCR101C 549 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 snR9snR9 187 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 APA2YDR530C 978 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YDR535CYDR535C 501 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YIL077CYIL077C 963 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 RPS1AYLR441C 768 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SHP1YBL058W 1272 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YMR310CYMR310C 954 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 RPS28AYOR167C 204 nt5.9□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 MDL1YLR188W 2088 nt5.9□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 SPH1YLR313C 1593 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 TRM8YDL201W 861 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 HLR1YDR528W 1272 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 MIC26YGR235C 702 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 SRP40YKR092C 1221 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YLR171WYLR171W 390 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 MRPS9YBR146W 837 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 PAT1YCR077C 2391 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 RBA50YDR527W 1320 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 NGL3YML118W 1518 nt5.89□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 RAD3YER171W 2337 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 TEL2YGR099W 2067 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YCL075WYCL075W 441 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YDL218WYDL218W 954 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YDR366CYDR366C 399 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 RMD6YEL072W 696 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 SLX9YGR081C 633 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YIL029CYIL029C 429 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 SDP1YIL113W 630 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YLR050CYLR050C 486 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 TOM22YNL131W 459 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YOR248WYOR248W 303 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 RBL2YOR265W 321 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YPL088WYPL088W 1029 nt5.88□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 GPB1YOR371C 2694 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 CWC2YDL209C 1020 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 MET32YDR253C 576 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 IZH1YDR492W 951 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 MAG1YER142C 891 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 RPL7AYGL076C 735 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 ZRT1YGL255W 1131 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YIP1YGR172C 747 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 AGE2YIL044C 897 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YKL083WYKL083W 615 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 AHP1YLR109W 531 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 SVS1YPL163C 783 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 RPL7BYPL198W 735 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 ARP9YMR033W 1404 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 RAD24YER173W 1980 nt5.87□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 AFG1YEL052W 1530 nt5.86□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 NUS1YDL193W 1128 nt5.86□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YDR269CYDR269C 324 nt5.86□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 TWF1YGR080W 999 nt5.86□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YJR037WYJR037W 384 nt5.86□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 RPL17AYKL180W 555 nt5.86□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 FOB1YDR110W 1701 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 GAT2YMR136W 1683 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 PHR1YOR386W 1698 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 PLM2YDR501W 1566 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 SUC2YIL162W 1599 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 LDB19YOR322C 2457 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 ATG31YDR022C 591 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 PUG1YER185W 912 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 MRPL9YGR220C 810 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YHR130CYHR130C 336 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 RPS5YJR123W 678 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YJR128WYJR128W 360 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 YFL042CYFL042C 2025 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 SIA1YOR137C 1869 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA3Q06623 VBA1YMR088C 1689 nt5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms