Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms