Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 YLR156WYLR156W 345 nt4.79□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.79□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 YLR159WYLR159W 345 nt4.79□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 YLR161WYLR161W 345 nt4.79□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 RPS19AYOL121C 435 nt4.79□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 ARO4YBR249C 1113 nt4.79□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 MPS3YJL019W 2049 nt4.79□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 EUG1YDR518W 1554 nt4.78□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 VPS45YGL095C 1734 nt4.78□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 SKG3YLR187W 3081 nt4.78□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 HNT2YDR305C 654 nt4.78□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 YGL177WYGL177W 348 nt4.78□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 YGL188CYGL188C 174 nt4.78□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4.78□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 COA3YJL062W-A 258 nt4.78□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 SPO19YPL130W 672 nt4.78□□□□□ -1.64
CEF1Q03654 PSY4YBL046W 1326 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 KTR6YPL053C 1341 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 GEM1YAL048C 1989 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 SAP4YGL229C 2457 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 SDS3YIL084C 984 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 BAT2YJR148W 1131 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YNL057WYNL057W 333 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RUF5-1RUF5-1 710 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RUF5-2RUF5-2 710 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 UFE1YOR075W 1041 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 ARC40YBR234C 1155 nt4.77□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 ZPR1YGR211W 1461 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 snR7-LsnR7-L 214 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RAD55YDR076W 1221 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YOS1YER074W-A 258 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 KXD1YGL079W 657 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YJL032WYJL032W 315 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 MAP1YLR244C 1164 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YLR444CYLR444C 303 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YPR027CYPR027C 834 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 LYP1YNL268W 1836 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 MGA1YGR249W 1371 nt4.76□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RPS18AYDR450W 441 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 LYS5YGL154C 819 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RPL8AYHL033C 771 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RIF2YLR453C 1188 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 MRP21YBL090W 534 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YAP7YOL028C 738 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RPB8YOR224C 441 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 LDH1YBR204C 1128 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 PBP2YBR233W 1242 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RRP7YCL031C 894 nt4.75□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 NUG1YER006W 1563 nt4.74□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 BRE4YDL231C 3378 nt4.74□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 DET1YDR051C 1005 nt4.74□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RMR1YGL250W 726 nt4.74□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 URA5YML106W 681 nt4.74□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 IDH2YOR136W 1110 nt4.74□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 SER3YER081W 1410 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 VBA2YBR293W 1425 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RSC3YDR303C 2658 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 FDC1YDR539W 1512 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YMR221CYMR221C 1515 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 UBP12YJL197W 3765 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 CPR4YCR069W 957 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YEA4YEL004W 1029 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 SPO11YHL022C 1197 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RFA3YJL173C 369 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 FYV6YNL133C 522 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RGS2YOR107W 930 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 HSH49YOR319W 642 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 ART10YLR392C 1557 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 SEG1YMR086W 2883 nt4.73□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YFL068WYFL068W 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 CAB2YIL083C 1098 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YKR070WYKR070W 1059 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 RRG9YNL213C 645 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 DSN1YIR010W 1731 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 MTH1YDR277C 1302 nt4.72□□□□□ -1.65
CEF1Q03654 POL1YNL102W 4407 nt4.71□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.5 ms