Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP4Q02446 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP4Q02446 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP4Q02446 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP4Q02446 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP4Q02446 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP4Q02446 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP4Q02446 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP4Q02446 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SP4Q02446 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP4Q02446 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP4Q02446 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP4Q02446 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP4Q02446 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP4Q02446 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP4Q02446 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP4Q02446 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP4Q02446 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP4Q02446 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP4Q02446 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP4Q02446 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SP4Q02446 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SP4Q02446 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP4Q02446 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP4Q02446 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP4Q02446 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP4Q02446 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP4Q02446 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SP4Q02446 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP4Q02446 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP4Q02446 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP4Q02446 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP4Q02446 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP4Q02446 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP4Q02446 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP4Q02446 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP4Q02446 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP4Q02446 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP4Q02446 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP4Q02446 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP4Q02446 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP4Q02446 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP4Q02446 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP4Q02446 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms