Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1AP61163 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1AP61163 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1AP61163 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1AP61163 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR1AP61163 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR1AP61163 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR1AP61163 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms