Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A1P60842 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF4A1P60842 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms