Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB15P59190 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB15P59190 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB15P59190 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB15P59190 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB15P59190 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB15P59190 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB15P59190 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB15P59190 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB15P59190 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB15P59190 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB15P59190 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB15P59190 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB15P59190 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB15P59190 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB15P59190 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms