Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP4BP1P59074 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms