Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK7P50613 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK7P50613 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK7P50613 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK7P50613 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK7P50613 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK7P50613 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK7P50613 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK7P50613 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK7P50613 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK7P50613 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK7P50613 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK7P50613 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK7P50613 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK7P50613 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK7P50613 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK7P50613 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK7P50613 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK7P50613 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK7P50613 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK7P50613 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK7P50613 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK7P50613 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK7P50613 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK7P50613 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK7P50613 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK7P50613 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK7P50613 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK7P50613 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK7P50613 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK7P50613 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK7P50613 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK7P50613 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK7P50613 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK7P50613 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms