Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCLCP48506 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCLCP48506 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GCLCP48506 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCLCP48506 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCLCP48506 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCLCP48506 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GCLCP48506 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLCP48506 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLCP48506 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLCP48506 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLCP48506 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLCP48506 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLCP48506 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLCP48506 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLCP48506 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLCP48506 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLCP48506 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLCP48506 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLCP48506 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLCP48506 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLCP48506 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLCP48506 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLCP48506 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLCP48506 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLCP48506 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLCP48506 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLCP48506 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLCP48506 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLCP48506 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLCP48506 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLCP48506 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLCP48506 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLCP48506 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLCP48506 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLCP48506 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLCP48506 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLCP48506 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLCP48506 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLCP48506 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLCP48506 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
GCLCP48506 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLCP48506 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms