Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME1P48163 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME1P48163 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME1P48163 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME1P48163 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME1P48163 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME1P48163 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME1P48163 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME1P48163 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME1P48163 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME1P48163 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME1P48163 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME1P48163 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME1P48163 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME1P48163 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME1P48163 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ME1P48163 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME1P48163 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ME1P48163 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ME1P48163 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ME1P48163 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ME1P48163 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME1P48163 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME1P48163 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME1P48163 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME1P48163 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ME1P48163 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME1P48163 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME1P48163 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME1P48163 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME1P48163 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME1P48163 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME1P48163 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms