Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRCC3P46736 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCC3P46736 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms