Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms