Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR1P43307 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR1P43307 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR1P43307 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR1P43307 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms