Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms