Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	YER034W	YER034W	558 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YGR126W	YGR126W	693 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	REC104	YHR157W	549 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	CPR3	YML078W	549 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	VPS53	YJL029C	2469 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	CDC45	YLR103C	1953 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	AVT7	YIL088C	1473 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YDR098C-A	YDR098C-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YDR210C-C	YDR210C-C	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YDR261C-C	YDR261C-C	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YDR316W-A	YDR316W-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YDR365W-A	YDR365W-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YER137C-A	YER137C-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YER159C-A	YER159C-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YGR027W-A	YGR027W-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YGR038C-A	YGR038C-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YGR161C-C	YGR161C-C	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YJR026W	YJR026W	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YJR028W	YJR028W	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YAR010C	YAR010C	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YLR157C-A	YLR157C-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YLR227W-A	YLR227W-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YLR256W-A	YLR256W-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YML040W	YML040W	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YML045W-A	YML045W-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YMR051C	YMR051C	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YNL054W-A	YNL054W-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YOL103W-A	YOL103W-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YPL257W-A	YPL257W-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YPR137C-A	YPR137C-A	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	YPR158C-C	YPR158C-C	1323 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	RDS1	YCR106W	2499 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	PCL9	YDL179W	915 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	GTT2	YLL060C	702 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	PEX12	YMR026C	1200 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	TYR1	YBR166C	1359 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	FAT1	YBR041W	2010 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VMA11	P32842	ZDS1	YMR273C	2748 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	SPT10	YJL127C	1923 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	GPI13	YLL031C	3054 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YHI9	YHR029C	885 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	SOD1	YJR104C	465 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	MRP8	YKL142W	660 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	CDA2	YLR308W	939 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	CDC73	YLR418C	1182 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	PRX1	YBL064C	786 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YBL077W	YBL077W	432 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	SPS2	YDR522C	1509 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	SPT6	YGR116W	4356 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	ERB1	YMR049C	2424 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	HFD1	YMR110C	1599 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	RAD4	YER162C	2265 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	FMP32	YFL046W	624 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	ERG26	YGL001C	1050 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	AIR1	YIL079C	1083 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	SPC3	YLR066W	555 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YNR071C	YNR071C	1029 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YPL088W	YPL088W	1029 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	POC4	YPL144W	447 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	PMT6	YGR199W	2280 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	CEX1	YOR112W	2286 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	BYE1	YKL005C	1785 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	APE2	YKL157W	2859 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YKL050C	YKL050C	2769 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YDR090C	YDR090C	933 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YIL086C	YIL086C	309 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	CDC8	YJR057W	651 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	VTA1	YLR181C	993 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	DCS1	YLR270W	1053 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YAR070C	YAR070C	300 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	AIM41	YOR215C	558 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	FDH1	YOR388C	1131 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	PEX1	YKL197C	3132 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	CUS1	YMR240C	1311 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YOR022C	YOR022C	2148 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	SPO1	YNL012W	1896 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	ORC4	YPR162C	1590 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YHL012W	YHL012W	1482 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	VFA1	YER128W	612 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YGR051C	YGR051C	324 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YAL065C	YAL065C	387 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	PFA4	YOL003C	1137 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	MPD1	YOR288C	957 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	SIP1	YDR422C	2448 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	GAC1	YOR178C	2382 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	MNR2	YKL064W	2910 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	SUC2	YIL162W	1599 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	PRR2	YDL214C	2100 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	BUD27	YFL023W	2391 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	SPB4	YFL002C	1821 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YCL075W	YCL075W	441 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	RTN1	YDR233C	888 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YER076C	YER076C	909 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YFL065C	YFL065C	309 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	RAI1	YGL246C	1164 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VMA11	P32842	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		2.92	□□□□□ -1.94

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