Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2BP30876 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms