Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRDP23468 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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