Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNFRSF1BP20333 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms