Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCFC2P16383 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms