Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HKR1P10072 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HKR1P10072 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HKR1P10072 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HKR1P10072 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HKR1P10072 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HKR1P10072 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HKR1P10072 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HKR1P10072 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HKR1P10072 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HKR1P10072 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HKR1P10072 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HKR1P10072 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HKR1P10072 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HKR1P10072 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HKR1P10072 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HKR1P10072 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HKR1P10072 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HKR1P10072 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HKR1P10072 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HKR1P10072 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HKR1P10072 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HKR1P10072 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms