Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMAP06454 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMAP06454 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMAP06454 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMAP06454 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMAP06454 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMAP06454 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMAP06454 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMAP06454 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMAP06454 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMAP06454 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMAP06454 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMAP06454 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMAP06454 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMAP06454 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMAP06454 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMAP06454 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMAP06454 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMAP06454 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMAP06454 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMAP06454 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMAP06454 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMAP06454 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMAP06454 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMAP06454 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMAP06454 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMAP06454 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMAP06454 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMAP06454 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMAP06454 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTMAP06454 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTMAP06454 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMAP06454 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMAP06454 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMAP06454 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMAP06454 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMAP06454 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMAP06454 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMAP06454 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTMAP06454 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTMAP06454 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTMAP06454 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTMAP06454 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTMAP06454 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTMAP06454 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTMAP06454 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTMAP06454 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTMAP06454 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTMAP06454 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTMAP06454 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTMAP06454 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTMAP06454 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTMAP06454 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTMAP06454 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTMAP06454 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTMAP06454 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTMAP06454 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTMAP06454 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTMAP06454 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTMAP06454 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTMAP06454 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTMAP06454 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTMAP06454 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTMAP06454 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTMAP06454 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTMAP06454 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTMAP06454 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTMAP06454 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTMAP06454 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTMAP06454 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTMAP06454 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTMAP06454 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTMAP06454 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms