Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APODP05090 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APODP05090 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APODP05090 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APODP05090 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APODP05090 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APODP05090 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APODP05090 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APODP05090 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APODP05090 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APODP05090 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APODP05090 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APODP05090 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APODP05090 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APODP05090 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APODP05090 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APODP05090 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APODP05090 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APODP05090 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APODP05090 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APODP05090 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APODP05090 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APODP05090 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APODP05090 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APODP05090 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APODP05090 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APODP05090 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APODP05090 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APODP05090 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APODP05090 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APODP05090 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APODP05090 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APODP05090 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APODP05090 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APODP05090 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APODP05090 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms