Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX7O95931 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX7O95931 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX7O95931 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX7O95931 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX7O95931 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX7O95931 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX7O95931 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX7O95931 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX7O95931 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX7O95931 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms